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IDT埃德特xGen™ NGS 杂交捕获

xGen NGS 的灵活杂交捕获解决方案,为您的研究带来质量、速度和客户支持。

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杂交捕获是一种靶向二代测序方法。在进行杂交捕获前,需要将 DNA 或 RNA 样本转化为测序文库。要构建文库,需要使用机械剪切法或酶切法将样本随机剪切成更小的片段,并且添加测序接头。根据文库设计,可能需要进行 PCR 扩增。

杂交捕获是一种靶向二代测序方法。在进行杂交捕获前,需要将 DNA 或 RNA 样本转化为测序文库。要构建文库,需要使用机械剪切法或酶切法将样本随机剪切成更小的片段,并且添加测序接头。根据文库设计,可能需要进行 PCR 扩增。

然后使用带有生物素标记的寡核苷酸探针(有时称为诱饵)对文库中的目标区域进行捕获(图 1)。带有生物素标记的探针旨在与目标区域(例如,外显子组、已知与癌症相关的基因,或某个代谢通路中的基因)进行杂交。在诱饵与片段化 DNA 或 RNA 杂交后,使用链霉亲和素将探针和靶向片段复合物与未与探针结合的其他片段分离开。探针可以采用不同的排列方式,以测序不同的目标区域。例如:

  • 叠瓦式探针可以使被测序区域端到端对准。
  • 重叠探针能够在目标序列末端进行额外测序,以确保序列的所有部分都得到覆盖。

还可对探针进行适当排列,识别难测序的基序(例如重复序列),由于 DNA 或 RNA 已在文库制备期间被随机剪切,所以捕获的片段是重叠且唯一的。

杂交捕获适用于基因分型和罕见变异检测。在扩增子测序中,PCR 引物在设计时必须避免任何由于单核苷酸变异 (SNV) 或 indel 导致的错配碱基。与之不同,杂交探针在更为复杂的序列捕获中表现更好。杂交捕获在发现突变方面的能力出色,特别适用于癌症研究。因为杂交捕获可以在设计时兼顾序列复杂度和可扩展性,这种方法对于外显子组测序也是更好的选择。

IDT xGen 杂交捕获产品包括多种预设计探针组和定制探针组,并提供多种探针组规格。提供已更新、支持自动化的高通量应用方案。

xGen 杂交探针组设计工具可以指导您完成为您的研究专门设计探针组的整个流程。设计好后,只需订购您的探针组就能开始您的研究。您设计的探针组也可以随时查询和查看。

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